- La circulation
La circulation routière ne sera pas affectée. À la fin des travaux, le chemin piétonnier à Meyrin reliant le complexe sportif de Maisonnex au chemin de la Berne sera restauré, avec un tracé modifié pour contourner les nouveaux bâtiments. Le tracé du chemin piétonnier à Cessy restera inchangé.
- Les espaces verts
Un aménagement paysager est prévu sur les deux sites, avec la plantation d’une vingtaine d’espèces locales d’arbres.
- Le bruit
Une étude acoustique des futures installations a été réalisée et intégrée aux permis de construire. Les émissions sonores resteront en-dessous des limites légales. Tous les nouveaux équipements du LHC à haute luminosité sont installés, soit dans des bâtiments de surface avec une isolation acoustique, soit en souterrain.
- L’eau
À Meyrin, un nouveau bassin de rétention d’eau sera installé pour réguler le rejet des eaux pluviales dans le cours d’eau le Nant d’Avril. Une nouvelle station de surveillance sera mise en service (le CERN compte 27 stations de surveillance de l’eau sur ses sites et à leurs abords). Un bassin similaire existe déjà à Cessy pour réguler les effluents relâchés dans l’Oudar. À Cessy, deux nappes phréatiques sont situées sous le site de l’expérience. Le chantier ne traversera que la nappe superficielle : une paroi circulaire étanche sera d’abord mise en place sur 15 mètres de profondeur, de manière à isoler la nappe et pouvoir creuser à l’intérieur. La nappe la plus profonde ne sera pas traversée par les travaux.